短链脂肪酸(Short-chain fatty acids, SCFA)是指碳原子数为2～6的有机脂肪酸，主要包括乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、戊酸、异戊酸、己酸和异己酸。SCFA主要由膳食纤维、抗性淀粉、低聚糖等不易消化的糖类在结肠受乳酸菌、双歧杆菌等有益菌群酵解而产生；生物样品中以乙酸、丙酸和丁酸含量最高，三者约占SCFA的85%以上。
短链脂肪酸在生物体内SCFA具有多种重要的生物学功能：
1、提供能量：SCFA可以为结肠细胞、黏膜上皮细胞及肌肉等供能，其中丙酸在糖异生过程中产生的葡萄糖能满足动物30%～50%的能量需求，丁酸因转化为β-羟丁酸而为机体供能，乙酸、丙酸和丁酸被肠粘膜上皮细胞吸收后均能作为其重要的能量来源；
2、维持水电解质平衡；
3、改善肠道血液循环；
4、刺激胃肠激素(如胃泌素和胃动素)分泌；
5、基因表达调控等。
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